El distrito de San José fue creado por la Ley del 2 de enero de 1857, promulgada por el segundo gobierno del mariscal Ramón Castilla.
Su capital es la caleta de San José. situada a 12.9 km. al Nor Oeste de la ciudad de Chiclayo y a 2 m.s.n.m. Según la leyenda, el personaje milico Naymlap habría desembarcado en sus playas, cerca a la desembocadura del río Faquisllanga, hoy río Lambayeque. En la Colonia, el pueblo de San José fue fundado por los pescadores sechuranos el 19 de marzo de 1694 y al convertirse la ciudad de Lambayeque en cabeza de Partido, en la tercera década del siglo XVIII, San José se convierte en Puerto Principal, reemplazando a Chórrepe. En la República, San José se convierte en Puerto Menor, por decreto del 26 de setiembre de 1826. y luego en Puerto Mayor, por la Ley de del 4 de Diciembre de 1845, llegando a tener gran desarrollo. A partir de 1874, con el funcionamiento del ferrocarril y muelle de Eten, y luego con el del puerto de Pimentel, San José decae enormemente, convirtiéndose en sólo una caleta de pescadores. Sin embargo, San José es la cuna del presidente Augusto B. Leguía (1863 - 1932), así como de la pionera de la educación Elvira García y García.
El distrito de San José está ubicado en el extremo Sur Oeste de la provincia de Lambayeque, a orillas del mar y en la región Chala. Sus límites son: Al Norte, con el distrito de Lambayeque; al Este, con los de Lambayeque y Chiclayo; al Sur, con el de Pimentel; al Oeste, con el Océano Pacífico.
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